Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms