Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms