Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF11Q99590 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms