Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA1Q99502 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA1Q99502 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms