Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms