Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF12Q96QT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms