Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2Q96Q42 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2Q96Q42 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms