Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CR12Q96Q35 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms