Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms