Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms