Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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