Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms