Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms