Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms