Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms