Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CSRNP3Q8WYN3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CSRNP3Q8WYN3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP3Q8WYN3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP3Q8WYN3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP3Q8WYN3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP3Q8WYN3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms