Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY2Q8WXA3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms