Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRSK1Q8TDC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRSK1Q8TDC3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms