Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CWC25-202ENST00000614790 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms