Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELBQ8NG08 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms