Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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