Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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