Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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