Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COLGALT1Q8NBJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms