Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms