Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms