Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TTC9CQ8N5M4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9CQ8N5M4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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