Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms