Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms