Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms