Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL3Q8IZI9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms