Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms