Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHA9Q7RTU4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms