Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MICAL3Q7RTP6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAL3Q7RTP6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms