Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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