Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms