Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms