Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms