Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms