Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN10Q6JVE6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms