Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIRMAQ69YN4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VIRMAQ69YN4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms