Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms