Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOCADQ5VW36 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms