Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms