Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFHC2Q5JST6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms