Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms