Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms