Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVEP1Q4LDE5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms