Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRY2Q49AN0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms