Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms